日本交通運輸發達，全國有188個機場，主要機場有30個，東京的羽田機場和成田機場是日本的空中大動脈，函館、福岡、大阪、關西、北九州、那霸的機場都是日本的空中交通樞紐。日本航空、全日空、北海道國際航空、天馬航空（sky）是日本四大航空公司，是日本空中交通的重要標志。
東京羽田國際機場（hnd）位于日本東京都大田區東南端（35°33′12′n，139°46′52′e）多摩川河口的左岸，是日本最大的機場，俗稱羽田機場（haneda airport），總面積408萬平方米。每天約有230個航班進出港，起落約460次。東京羽田國際機場作為首都東京航空運輸的出入門戶，經營國內和少量國際航空客貨運輸業務。上海到日本東京（hnd）物流網可提供空運直達，深圳到東京空運需經上海、仁川、北京等機場中轉，時效3-5天，空運價格實惠，航班天天，ak、br、ca、ci、sq都可到達。
東京成田國際機場（nrt）位于日本關東地區，距東京市區68公里之遙的千葉縣成田市，是日本最大的國際航空港。東京成田國際機場年旅客吞吐量居日本第二位（第一位羽田機場），貨運吞吐量居日本第一、全球第三。成田空港是日本航空、全日空、美國聯合航空公司、美國西北航空公司（已被收購，現為達美航空成員）美國達美航空公司的亞洲樞紐港。根據日本機場分類法，成田機場與東京羽田機場、大阪國際機場、關西國際機場和中部國際機場統一劃分為一類機場。深圳到東京成田機場空運有直達航班，5x、hu、oz、zh、br、ca、ci、sq都可到達，時效3-4天。
大阪伊丹國際機場（osaka itami international airport），亦名大阪國際機場（osaka international airport），三字代碼：itm；四字代碼：rjoo）。位于東經135度21分21秒、北緯34度47分04秒，日本兵庫縣伊丹市、大阪府豐中市、池田市三者交界地帶，海拔高度12米，根據日本《空港整備法》被分為第一種機場。
大阪關西國際機場（英語：kansai international airport，三字代碼：kix，四字代碼：rjbb）通稱為大阪關西機場或簡稱（大阪）關空，是一座由3個日本大阪府的行政單位管理的機場，分別是泉佐野市（北）、田尻町（中）和泉南市（南），為京阪神都會區和關西地方的主要機場，鄰近有神戶機場、大阪國際機場，位于大阪灣東南部的泉州近海離岸5千米的人工島上。根據日本《空港整備法》，該機場被分為第一種機場。物流網深圳到大阪空運航線眾多，（ups航空、友和道航空、深圳航空）有直飛航線，也有中轉航線，時效一天左右，還有免費的大阪空運費查詢服務。
那霸國際機場(oka)位于日本沖繩縣那霸市，屬于民用機場。那霸機場是一座位于日本沖繩縣那霸市的民用機場。我國的北京、上海、杭州、香港、南京、沈陽、天津等機場都有直達航班到這里，主要航空公司有首都航空、吉祥航空、中國國際航空、中華航空、香港航空、港龍航空、中國東方航空等。深圳到那霸空運，大韓航空執飛，經仁川中轉，時效2-3天。
福岡國際機場（icao：rjff；iata：fuk）是一個位于日本福岡縣福岡市博多區的國際與國內機場，1945年建成。因該機場曾為美國空軍所駐扎之板付基地，所以又曾稱為板付機場。是日本離市中心最近的機場。深圳到福岡空運無直達航班，需經北京、東京、仁川、臺北、新加坡等機場中轉，主要航空公司有新加坡航空、大韓航空、韓亞航空、中華航空、國航、聯合包裹航空、長榮航空等，時效3-4天。
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